（2003年2月1日 财政部、国家计委、卫生部 财社[2003]10号发布）
实行医院门诊药房脱离改革是全面推进和完善“卫生三项改革”的重要举措。为了完善试点医院的补偿机制，促进医院健康发展，根据国家计委等部门《关于完善“三项改革”试点工作的指导意见》（以下简称《指导意见》）和有关规定，现就试点医院门诊药房脱离医院后的补偿办法提出以下意见：
一、基本原则
试点城市要认真分析医院的收支状况，合理测算医院门诊药房脱离对医院经济运行机制的影响，综合分析、预测试点门诊药房脱离后医院维持正常运转所需的经济保障条件，通过深化医院内部改革、逐步调整医疗服务价格、合理安排财政补助等措施，采取多种渠道对医院的医疗服务成本给予合理补偿，使试点的非营利性医院能够做到收支平衡，并具备一定发展能力。
二、补偿渠道和标准
门诊药房脱离试点医院医疗服务成本的补偿渠道和补偿标准：
1．逐步提高医疗服务价格的补偿水平。价格主管部门应根据门诊药房脱离后医院医疗服务消耗的有关情况，在认真做好成本测算的基础上，按照“总量控制，结构调整” 的原则，合理确定提高医疗服务价格的幅度。
2．试点医院门诊药房的资产应在认真进行清产核资的基础上，通过公开招标等规范方式有偿出售或出租，所得收人纳人部门预算管理，全部用于医院发展或弥补医疗服务成本。在医院门诊药房资产出售或出租过程中，有关部门要加强监督管理，防止国有资产流失。
3．医院住院药品纯收人继续用于弥补医疗服务成本。试点医院住院药品收人继续按照（医院药品收支两条线管理暂行办法）（卫视财发［2000］229号）实行收支两条线管理，卫生、财政部门要及时拨付应返还医院的住院药品收支结余资金。
4．加强管理，降低运营成本。试点医院要认真贯彻（指导意见）的精神，切实推进医院内部运行机制改革，加强医院的全成本核算，积极主动挖掘内部潜力，在保证医疗服务质量的同时，努力提高工作效率，降低运行成本和管理成本。
5．门诊药房从医院脱离后组建的药品零售企业上交中央和地方的税收，在试点期间，通过财政预算安排专项用于补助试点医院。具体补助数额根据门诊药房脱离改革前一至二个会计年度医院门诊药房的药品收支情况和相关税收制度测算核定。增值税数额按照门诊药品销售收人与其购药成本的差额及规定税率测算，企业所得税数额按照门诊药品收支结余及规定税率测算。其中上缴中央财政的部分按照财政管理体制规定计算确定，通过年终结算返还给地方财政。
6．合理安排财政补助。试点城市有关部门应对门诊药房脱离后医院收支情况进行全面测算，在认真考核医院各项费用开支基础上，根据医疗服务平均成本或标准成本及有关渠道弥补后的差额，按有关规定合理确定对医院的财政补助数额，5年不变由同级财政部门直接向试点医院拨付。对确有特殊困难的试点地区，由中央财政在安排对地方转移支付时统筹考虑。
在保证离退休人员费用的同时，地方计划、财政部门要根据试点城市区域卫生规划和政府财力状况，适当增加设备购置、大型房屋修缮、就医环境改善、重点学科建设等专项经费和基本建设投资，改善群众就医条件。
试点城市要针对中医药和民族医药的学科特点，在安排财政补助及制定有关政策时，对试点中医医院、民族医院给予适当照顾。
三、有关要求
由于医疗机构补偿机制问题非常复杂且涉及面广，试点城市卫生、财政、计划、价格等部门要在试点改革领导小组的领导下，密切配合，根据当地经济状况、居民收人和医院发展需要等，认真做好区域卫生规划，调整和优化卫生资源，明确政府责任，发挥市场作用，建立与当地经济发展水平相适应的卫生服务体系，并根据（指导意见）和本通知精神，研究制定具体办法，认真落实试点医院的补偿政策，促进试点工作的顺利进行，保证人民群众的基本医疗，满足群众不同层次的医疗需求。
卫生部门要认真研究门诊药房脱离对医疗机构正常运转的影响和可能产生的问题，及时提出相应的解决办法，同时积极推进医疗机构内部改革，提高医院运行效率；财政部门要认真分析测算门诊药房脱离对医院收支的影响，合理确定对医院的补助范围和标准，切实落实财政补助政策，同时要按照直接拨付财政补助经费的要求，加强对试点医院的财务监管，规范医院收支管理；价格部门要合理制定医疗服务价格调整方案，建立灵敏的药品价格调整机制；计划部门积极推进区域卫生规划，加快卫生资源调整步伐，合理安排医院基本建设项目。